Molekyler er de mindste partikler af en kemisk forbindelse, som har de kemiske egenskaber, der kendetegner denne forbindelse. Forbindelser er stoffer, der er dannet af to eller flere forskellige atomer, der er kemisk bundet sammen. Molekyler er den mindste enhed i en forbindelse, der har de samme kemiske og fysiske egenskaber som forbindelsen.
Molekyler er utroligt små; faktisk så små, at man ikke kan se dem med det blotte øje. Men på trods af deres lille størrelse spiller molekyler en stor rolle i vores liv. Alt omkring os består af molekyler: luften vi indånder, vandet vi drikker, maden vi spiser. Selv vores egen krop består af billioner af molekyler.
Molekyler holdes sammen af kemiske bindinger. Der findes flere forskellige typer kemiske bindinger, men den mest almindelige type er den kovalente binding. I en kovalent binding deler to atomer elektroner ligeligt. Dette skaber en stærk binding, der holder atomerne sammen.
Molekyler findes i alle former og størrelser. Nogle molekyler er lange og tynde, mens andre er runde og kompakte. Nogle molekyler er polære, hvilket betyder, at de har en positiv og en negativ ende, mens andre er upolære. Et molekyls form og polaritet bestemmer dets egenskaber. Polære molekyler opløses f.eks. i vand, mens upolære molekyler ikke gør det.